Der Controller braucht 4 Pin um das PWM Signal für den Lüfter zu steuern. Nur Lüfter mit 4 Pin Kabel erlauben die Anpassung der Geschwindigkeit, Lüfter mit 3-Pin Kabel haben eine fixe Geschwindigkeit.
Somit muss das Kabel welches den Kontroller mit den Lüftern verbindet immer 4-Pin sein, oder der Kontroller macht keinen Sinn. Die Stromzufuhr zum Kontroller kann mit einem Adapter welcher den Strom an der PSU oder anderer Stromquelle abgreift erreicht werden.

Benutze das Teil um den Lüfter im RaspberryPie runterzuregeln mit 2 PIN Anschluss

Ja, dies sollte ohne Probleme funktionieren.