Wenn's mit umplatzieren der Grafikkarte auf einen anderne Steckplatz nicht geht, damit der Slot frei wird, kann man je nach Gehäuse oder mit einem auch mit einem "Riser Cable" behelfen und die Grafikkarte anders im Case platzieren. Mit einem gewinkelten Riser Cable auf der F-Seite (=female) des Kabels, also wo die Karte dann reingesteckt wird, sollte es im Prinzip mit jedem Gehäuse gehen. Je nach Grafikkarte ist aber unbedingt auf PCIe 3.0- bzw. PCIe 4.0-Kompatibilität zu achten. Ob's inzwischen 4.0-Riser Cable gibt, weiss ich jetzt gerade nicht.
Ansonsten: Von Anfang an immer ein Mainboard wählen, das mehr PCIe-Slots hat. Dann ist man mit den Steckplätzen etwas flexibler. Allerdings ist auch dies wiederum davon abhängig, wieviele PCIe-Karten man verbauen will, was für Slots das Mainboard bietet und mit welchem PCIe-Standard (1x/4x/8x/16x) die Karten jeweils daherkommen.