Fälschlicherweise für die brutalen Morde an seinen Klassenkameraden durch den mysteriösen Roten Mann verurteilt, findet sich der Mittelschüler Ganta Igarashi zum Tode verurteilt und in den bizarren und tödlichen Freizeitpark/Gefängnis wieder, das aus den Ruinen des Grossen Erdbebens von Tokio entstanden ist – ein Höllenort auf Erden, bekannt als „Deadman Wonderland“.

Fälschlicherweise beschuldigt, seine Klassenkameraden ermordet zu haben, und zum Tode verurteilt in Deadman Wonderland, beginnt Ganta, mehr über das Leben hinter den Gefängnismauern zu erfahren. Als er hört, dass der Rote Mann, das seltsame Wesen, das seine Freunde getötet hat, im G-Block ist, macht sich Ganta auf den Weg dorthin, um Antworten – und Rache – zu suchen. Stattdessen trifft er auf einen geheimnisvollen Mann, der ihn „Specht“ nennt.