Lyra ist ein Waisenkind, das in einem Paralleluniversum lebt, in dem Wissenschaft, Theologie und Magie miteinander verwoben sind. Ihre Suche nach einem entführten Freund enthüllt eine finstere Verschwörung, die gestohlene Kinder betrifft, und entwickelt sich zu einer Reise, um ein mysteriöses Phänomen namens Staub zu verstehen.