Dieser zugängliche Text bietet eine detaillierte Einführung in die Verwendung einer Vielzahl von Softwaretools und Modellierungsumgebungen für die Biowissenschaften sowie in die grundlegenden mathematischen Hintergründe. Die praktischen Einschränkungen, die durch jede Modellierungstechnik entstehen, werden ausführlich beschrieben, sodass der Forscher bestimmen kann, welches Softwarepaket für ein bestimmtes Problem am nützlichsten ist.

Zu den Merkmalen gehören eine Einführung in eine grundlegende Reihe von Techniken zur Formulierung von Modellen biologischer Systeme und deren Lösung; Diskussionen über agentenbasierte Modelle, stochastische Modellierungstechniken, Differentialgleichungen, räumliche Simulationen und Gillespies stochastischen Simulationsalgorithmus; Übungen; Beschreibungen nützlicher Werkzeuge wie dem Maxima-Algebrasystem, dem PRISM-Modellprüfer und den Modellierungsumgebungen Repast Simphony und Smoldyn; sowie Anhänge zu den Regeln der Differenzierung und Integration und Maxima.