Das Buch der Ketzer erzählt von "verunglückten Heiligen", wie Walter Nigg sie nennt. Mit grosser Empathie schreibt er über Gottes- und Wahrheitssucher, die von der Kirche ausgestossen wurden oder sich von ihr getrennt haben. Darunter finden sich "Hexen" und Katharer, aber auch berühmte Philosophen und Theologen, Literaten und Wissenschaftler.